Vamos a intentar hacer fáciles de entender estos términos tan complicados y para poder entenderlos debemos primero definirlos.
Los discos duros deben de ordenarse (particionar y formatear) para que puedan ser interpretados y escritos los datos que contengan. Hay básicamente dos formas de conseguirlo.

GPT (Tabla de Partición GUID)
Es un estándar para la colocación de la tabla de particiones en un disco duro físico. Es parte del estándar Extensible Firmware Interface (EFI) propuesto por Intel para reemplazar la desfasada BIOS del PC, una de las pocas réplicas que quedan, heredada del IBM PC original.
MBR (Master Boot Record)
Es el primer sector (“sector cero”) de un dispositivo de almacenamiento de datos, como un disco duro. A veces, se utiliza para el arranque del sistema operativo con bootstrap, otras veces es usado para almacenar una tabla de particiones y, en ocasiones, se usa sólo para identificar un dispositivo de disco individual, aunque en algunas máquinas esto último no se usa y se ignora. Leer más